É consenso na área portuária internacional que os portos que realmente têm futuro são aqueles dotados de boa profundidade de acesso aquaviário. Para melhorar o acesso marítimo, são propostas duas etapas de intervenções para o aprofundamento e regularização dos canais de acesso e acostagem de navios. O Projeto Revitalização do Porto do Rio Século XXI, contempla estas melhorias em 6 etapas: O custo das 6 etapas está estimado em R$ 90 milhões.

1ª Etapa
 Desassoreamento da área de acostagem do Cais da Gamboa e do Cais de São Cristovão para a cota de 10 metros (permitida pelo projeto original do cais). Na maior parte da extensão da linha de cais será apenas necessária a realização da dragagem, porém foram identificados alguns pontos onde há necessidade de promover derrocamentos, que atualmente impedem a utilização da cota de construção ao longo desses techos do cais.

2ª Etapa
O cais dos Terminais de Contêineres será regularizado com profundidade na cota de -12,5m. A bacia de evolução será ampliada e terá diametro de 437m e cota de -12,5m.

3ª Etapa
A demolição do armazém frigorífico, abriu a possibilidade de utilização da área com graneis sólidos e produtos siderúrgicos semi acabados. Estas mercadorias requerem para o seu embarque, gradativamente, navios de maior porte. Nesta circunstância, o projeto prevê o aprofundamento do berço fronteiro a essa área, para a cota de 13,5 metros, bem como do respectivo canal de acesso.

4ª Etapa
Receber navios para até 6.000 TEUs no cais do Cajú será possível a partir da implementação da 5ª Etapa do projeto, que consiste no aprofundamento da área de acostagem e do respectivo canal de acesso para a cota de -15 metros. A bacia de evolução deverá ser ampliada para um diâmetro de 580 metros, permitindo o giro de navios deste porte.

5ª Etapa
A agregação de novas retroáreas ao cais de São Cristovão e o esperado incremento da movimentação de produtos siderúrgicos nesta área do Porto do Rio apontam para a necessidade de operar navios de maior porte. Nestas condições a 4ª Etapa do projeto consiste no aprofundamento da área de acostagem deste cais para a cota de -13,5 metros, bem como na preparação de uma nova bacia de evolução entre este cais e o do Caju, o que permitirá, com a adequação dos canais, o acesso ao cais nos dois sentidos, conferindo-lhe maior operacionalidade.

6ª Etapa
O aumento da freqüência de navios na nova fase do Porto do Rio será uma realidade. Nessas condições será indispensável dotar o canal principal de acesso com largura de 240 metros e profundidade de15 metros, permitindo o tráfego de navios nos dois sentidos.